脈沖除塵器(也稱行噴吹除塵器)在接到清灰指令后，控制噴吹的脈沖閥立刻使壓縮空氣在極短時間內(≤0.2s)高速噴入濾袋，同時誘導數倍于噴射氣流的空氣形成空氣波，使濾袋由袋口至底部產生急劇的膨脹和沖擊振動，造成積灰下落的作用。在進行脈沖噴吹時，濾袋仍然進行煙氣過濾。噴吹氣流阻擋過濾煙氣的同時，用瞬間的脈沖振蕩使粉塵剝落進入灰斗，這種清灰方式叫做在線清灰。
脈沖除塵器的本體分隔成若干箱室，每箱按過濾面積有若干條濾袋，并在每箱側邊出口管道上有一個氣缸帶動的提升閥。當過濾含塵氣體一定時間后(或阻力達到預先設定值)，清灰控制器發出信號，個箱室的提升閥開始關閉切斷過濾氣流，脈沖閥開啟，使0.6MPa壓縮空氣沖入凈氣室，凈氣室內空氣瞬間膨脹使脹濾袋劇烈振動清除濾袋上的粉塵，之后提升閥重新打開，使箱室重新進入工作狀態。這種清灰方式稱做離線清灰。
